重慶辣椒上煙草輕型綠花葉病毒的分子檢測及全基因組克隆分析
摘要：辣椒是重慶重要的經濟作物,煙草輕型綠花葉病毒(Tobacco mild green mosaic virus,TMGMV)引起的病毒病對辣椒生產造成了嚴重影響.為明確TMGMV在重慶辣椒上的發生、分布情況及其基因組特征,從重慶北碚、石柱、潼南和九龍坡4個區縣采集29份疑似病毒病樣品進行了RT-PCR鑒定,通過分段擴增測序的方法拼接獲得病毒基因組全序列并進行了系統進化分析.檢測結果表明:29份樣品中有9份檢測到TMGMV,檢出率為31.03%,其中石柱縣的檢出率最高,為60.00%.序列分析發現,重慶辣椒分離物TMGMV-TN29基因組全序列具有煙草花葉病毒屬(Tobamovirus)病毒典型基因組結構特征,由6356nt構成.系統進化分析得出,該分離物與TMGMV廈門分離物Xiamen(JX534224)具有較近的親緣關系,核苷酸序列相似性達到99.75%.
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