《南昌大學學報》分為人文社會科學版、 工科版、 理科版、 醫學版。

《南昌大學學報人文社會科學版》主要刊登哲學、經濟學、法學、文學、史學、新聞、藝術、語言文字、圖書情報學等人文社會科學各學科的最新科研成果。常設欄目有馬克思主義研究、道德與人生、政治與社會、哲學與時代、經濟與管理、法學與法治、新聞與傳播、歷史與文化、詩學縱橫、文藝思潮與創作評論、當代社會保障研究、語言與文字、教育與科學、學術爭鳴園地等，“道德與人生”欄目獲全國高校社科期刊“優秀欄目”。 “詩學縱橫”欄目獲全國高校社科期刊“特色欄目”。

《南昌大學學報(工科版)》是南昌大學主辦的工程技術類綜合性學術期刊，季刊，國內外公開發行。1964年創刊，原名《江西工學院學報》，1985年改為《江西工業大學學報》，1993年更為現名。本刊堅持“二為”方向、“雙百”方針，展示高水平研究成果，扶持學術人才成長，促進學術交流，為國家和地方社會發展經濟建設服務。主要刊載化工、環境、機械、食品、自動化、電子、計算機、水利、水電、土木建筑工程、材料科學與數理學科等方面的學術論文和研究報告，積極報道科研單位、高等院校等工程技術類的最新研究成果。本刊為中國科技論文統計源核心期刊。

《南昌大學學報(理科版)》是南昌大學主辦的自然科學綜合性學術理論刊物，雙月刊，公開發行。1963年創刊，原名《江西大學學報（自然科學版）》，1993年更為現名。本刊堅持“二為”方向、“雙百”方針，展示高水平研究成果，扶持學術人才成長，促進學術交流，為國家和地方社會發展經濟建設服務。主要刊登數學、物理學、化學、生物學、食品科學、電子科學、計算機科學、材料科學、管理科學等學科基礎理論研究和應用基礎研究方面的研究報告、簡報、快報、等學術論文，注重反映南昌大學理科各學科的最新科研成果，促進學術交流。本刊為中文核心期刊（綜合性科學技術類）和中國科技論文統計用刊源之一。

《南昌大學學報（醫學版）》（原江西醫學院學報）是一份由南昌大學主管、主辦的綜合性醫藥衛生類學術期刊，創刊于1956年11月，雙月刊，雙月末出版，國內外公開發行。 本刊堅持“二為”方向、“雙百”方針，展示高水平研究成果，扶持學術人才成長，促進學術交流，為國家和地方社會發展經濟建設服務。主要報道醫學研究領域新的科研成果和研究動態，以醫學教學、科研、醫療工作者為主要讀者對象。設有基礎醫學、臨床醫學、綜合報道、綜述４個固定欄目，以及專題研究、方法?技術、調查研究、病例報告、科研信息、讀者?作者?編者６個機動欄目。作為江西省醫學期刊的一個重要組成部分，該刊始終注重稿件學術質量建設，克服期刊在定位上的內向性、內容上的綜合性和地方性院校的局限性，在傳播醫學科研信息、推動醫學科研發展方面起到了重要的的作用。