《西南國防醫藥》經新聞出版總署批準，自1991年創刊，國內刊號為51-1361/R，本刊積極探索、勇于創新，欄目設置及內容節奏經過編排與改進，受到越來越多的讀者喜愛。

《西南國防醫藥》以傳遞醫學科技信息、加強學術交流、促進醫學科學技術發展為宗旨，以各類醫務人員為主要讀者對象。

《西南國防醫藥》雜志是成都軍區衛生部主管，成都軍區醫學科學技術委員會主辦的綜合性醫學學術刊物。創刊于1973年，創刊時刊名為《資料匯編》，為不定期刊物，刊載內容以醫學臨床專題講座、綜述為主。1979年更名為《醫學資料匯編》，定期季刊出版，刊載內容較以前有了很大改變，主要以科研課題論文、臨床研究論文為主。1985年原昆明軍區與成都軍區合并后，改名為《西南部隊醫藥》，仍為季刊。1991年經解放軍總政治部和國家新聞出版署審查批準《西南部隊醫藥》更名為《西南國防醫藥》（雙月刊），在國內外公開發行，是全軍各大軍區、軍兵種主辦的同類期刊中第一個公開發行的醫學刊物。2000年經國家科技部科技信息研究所審查批準，《西南國防醫藥》被收錄為中國科技論文統計源期刊，列為國家科技核心期刊。2009年1月經解放軍總政治部和國家新聞出版批準，《西南國防醫藥》改為單月刊，是全軍同類期刊中第一本月刊。目前，《西南國防醫藥》已被美國化學文摘（CA）、波蘭哥白尼索引、英國國際農業與生物科學研究中心及中國科技論文統計源等國內外十余個主要期刊數據庫收錄，是萬方期刊網、清華學術光盤版、中文科技期刊數據庫全文上網期刊，是國家級核心刊物，也被多個省（市、區）列為A類期刊，作為晉升高級專業技術職務的認可刊物。 《西南國防醫藥》以傳遞醫學科技信息、加強學術交流、促進醫學科學技術發展為宗旨，以各類醫務人員為主要讀者對象。辟有專家論壇、論著、臨床研究、高原醫學、中醫•中西醫結合、護理園地、醫院管理、衛勤研究、基層衛生、綜述•講座等欄目，集學術性、技術性及實用性為一體，具有軍事醫學和高原及亞熱帶疾病防治等特色。