植物乳桿菌WCFS1和JDM1的糖代謝PPI網(wǎng)絡(luò)魯棒性研究
摘要:由于生長環(huán)境不同,植物乳酸桿菌WCFS1和JDM1的糖代謝存在差異。為研究兩者糖代謝差異,本文利用復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)理論,構(gòu)建植物乳酸桿菌WCFS1和JDM1糖代謝的蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用(Protein-Protein Interaction,PPI)網(wǎng)絡(luò)。通過研究兩者糖代謝PPI網(wǎng)絡(luò)的魯棒性,發(fā)現(xiàn)在隨機(jī)攻擊、度攻擊、介數(shù)攻擊三種方式下, WCFS1的檸檬酸循環(huán)模塊、戊糖磷酸途徑模塊的PPI網(wǎng)絡(luò)的魯棒性優(yōu)于JDM1,較JDM1有較強(qiáng)的容錯(cuò)性。此外,發(fā)現(xiàn)WCFS1和JDM1的糖代謝PPI網(wǎng)絡(luò)受介數(shù)高的節(jié)點(diǎn)影響較大。
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