綿羊骨骼肌轉錄組高通量測序從頭組裝和特征分析
摘要：本實驗旨在對綿羊肌肉轉錄組進行組裝分析,以豐富綿羊的基因組并為進一步對綿羊的相關基因的分子遺傳學研究奠定基礎。選取Illumina Hiseq 2000測序平臺對杜泊羊和小尾寒羊的骨骼肌轉錄組文庫進行了高通量測序,并對測序數據進行從頭組裝分析。結果表明：兩個測序文庫共得到103058824個長為2×90bp的高質量的測序序列,經從頭組裝共產生了145524個unigenes。兩個文庫間有5718個unigenes差異表達,經GO注釋分析后發現它們主要分布在細胞、細胞過程和結合條目中。將兩個文庫的unigenes進一步組裝得到70348個平均長為863bp的all-unigenes,其中35201個被注釋到Nr數據庫,12219個被注釋到COG數據庫,并與KEGG數據庫中的258個功能通路中的蛋白質和氨基酸新陳代謝通路密切相關。
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