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擴增子測序分析助力傳統(tǒng)發(fā)酵食品微生物群落研究

孫善峰; 黃曉寧; 韓北忠; 陳晶瑜 中國農(nóng)業(yè)大學(xué)食品科學(xué)與營養(yǎng)工程學(xué)院食品質(zhì)量與安全北京實驗室; 北京100083; 中國農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)業(yè)部葡萄酒加工重點實驗室; 北京100083

摘要：高通量測序技術(shù)的發(fā)展促進了基因組學(xué)技術(shù)在中國傳統(tǒng)發(fā)酵食品微生物研究中的應(yīng)用,而擴增子測序是目前相對成熟且普遍使用的基因組學(xué)技術(shù)。采用生物信息學(xué)方法分析由測序產(chǎn)生的大量序列數(shù)據(jù),揭示數(shù)據(jù)隱藏的生物學(xué)信息至關(guān)重要。生物信息學(xué)貫穿于擴增子測序數(shù)據(jù)的收集、存儲、處理和分析等各個階段。該文歸納了目前在擴增子數(shù)據(jù)分析中常用的數(shù)據(jù)庫、算法及生物信息分析工具,總結(jié)了近幾年基于擴增子測序的生物信息學(xué)方法在中國傳統(tǒng)發(fā)酵食品研究中的應(yīng)用,為擴增子測序分析技術(shù)的改進和發(fā)展提供參考。

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